软件著作权证书丢失补办方法如下：
1、可以登录“中国版权保护中心”网站，申请补发证书。
2、申请补发证书之前需要先申请“计算机软件著作权证书查询”。
3、取得查询结果后，再申请补发证书。
4、查询、申请的材料可以同时提交至窗口（也可以邮寄，不过邮寄的材料受理的很慢）。版权中心现不收取任何官费。
客户申请办理中华人民共和国国家版权局颁发的《计算机软件著作权登记证书》需要提交以下材料：
1、 按要求填写《计算机软件著作权登记申请表》证书需要提交以下材料。
2、提供源程序前、后各连续40页。源程序不到60页的，应提交整个源程序。(电子文件、Word文档格式或纯文本格式可以接受)
3、文档(如：用户手册、操作手册、设计说明书、使用说明书等任选一种)的前、后各连续40页。整个文档不到60页的，应当提交整个文档。(电子文件、Word文档格式或纯文本格式可以接受)
4、非职务软件开发保证书。(即：权利保证书)
5、原创版本说明(适用于申请登记的软件版本为1.0以上者，如版本为1.0则不需要提交)
6、相关证明文件。(A4纸复印)
（1）个人申请者提交身份证复印件，单位申请者提供营业执照副本复印件；
（2）有著作权归属书面合同或项目任务书的应提交；
（3）经原软件著作权许可，在原有软件上开发的软件，应提交原著作权人的许可证明；
（4）如有权利转移，应提交权利继承人、受让人或承受人，提交权利继承、受让或承受的证明。
【本文所涉及的法律依据】：：
《计算机软件保护条例》
第二十五条
登记证书遗失或损坏的，可申请补发或换发。
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